包茎或包皮过长时，使包皮内的皮脂腺的分泌物不能排出，并逐渐形成包皮垢，包皮垢适于细菌生长，故可引起阴茎头包皮炎，发生尿道口的炎症，愈合后会引起尿道口狭窄，造成排尿的困难。

引发尿路感染：

根据1995年美国对2500名男婴的调查，未割包皮的尿路感染率为4.1%，已割包皮则为0.2%。而1996年对40万名婴儿的研究显示，未割包皮者会有高10倍的尿路感染率。

导致性病、生殖器官癌症等：

有研究表明，割包皮者的性病感染率更低，甚至能显著降低男性的人乳头瘤病毒（HPV）感染。犹太人在阴茎癌、子宫颈癌上的患病率更低，也很可能与他们割包皮的习俗有关。